138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-2 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0898  tRNA-Met  88.89 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.542137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60410  tRNA-Lys  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60080  tRNA-Lys  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.662949  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0005  tRNA-Met  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  88.14 
 
 
78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  88.14 
 
 
78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0077  tRNA-Ile  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t13  tRNA-Lys  86.44 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000197803  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t15  tRNA-Lys  86.44 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00592778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t23  tRNA-Lys  86.44 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0017  tRNA-Met  85.71 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0069  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0013  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671128  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0006  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0019  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0023  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483776  normal  0.0816799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0025  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.469225  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0039  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  0.700265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0073  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0065  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.448477  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0028  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0030  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692876  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0084  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00102646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Undet-2  tRNA-OTHER  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00119652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0003  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281638  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.47791e-17  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373328  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3561  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0085  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000813778  normal  0.199045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0074  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000283868  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0002  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000230131  normal  0.891298 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  86.21 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000962066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0080  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000338502  normal  0.0447756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0083  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00594726  hitchhiker  0.00848998 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0002  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000350772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0630  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000358951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0015  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1168  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3108  tRNA-OTHER  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0021  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3542  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000176081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3771  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1897  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000326046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0451  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000861807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3541  tRNA-OTHER  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00194586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0020  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559098  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0068  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00409998  normal  0.989602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>