35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0158 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0158    100 
 
 		 360 bp  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.225068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  100 
 
 		 705 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  100 
 
 		 705 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  100 
 
 		 705 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  100 
 
 		 705 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  100 
 
 		 723 bp  569  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  99.65 
 
 		 705 bp  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  99.65 
 
 		 705 bp  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  99.65 
 
 		 705 bp  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  99.65 
 
 		 705 bp  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  99.3 
 
 		 705 bp  553  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  99.3 
 
 		 705 bp  553  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  99.3 
 
 		 705 bp  553  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  99.3 
 
 		 723 bp  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  99.3 
 
 		 705 bp  553  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1577  replication initiator protein  100 
 
 		 117 bp  149  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0751951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  98.72 
 
 		 462 bp  147  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1566  transposase  100 
 
 		 219 bp  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0447149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  100 
 
 		 933 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0077  replication initiator protein  100 
 
 		 180 bp  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265046  normal  0.478776 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0137    100 
 
 		 789 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0131    100 
 
 		 354 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.825654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0054  insertion sequence  100 
 
 		 249 bp  125  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0114  hypothetical protein  100 
 
 		 300 bp  77.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0253401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>