10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0137 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0137    100 
 
 		 789 bp  1564    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0131    100 
 
 		 354 bp  147  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.825654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  100 
 
 		 933 bp  145  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0158    100 
 
 		 360 bp  145  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.225068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1566  transposase  100 
 
 		 219 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0447149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1577  replication initiator protein  100 
 
 		 117 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0751951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  100 
 
 		 462 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0077  replication initiator protein  100 
 
 		 180 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265046  normal  0.478776 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0054  insertion sequence  100 
 
 		 249 bp  125  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0114  hypothetical protein  100 
 
 		 300 bp  77.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0253401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>