15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0131 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0131    100 
 
 		 354 bp  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.825654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  100 
 
 		 558 bp  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0047    100 
 
 		 153 bp  293  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000130394  normal  0.301815 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0137    100 
 
 		 789 bp  147  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  100 
 
 		 933 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0158    100 
 
 		 360 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.225068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1566  transposase  100 
 
 		 219 bp  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0447149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1577  replication initiator protein  100 
 
 		 117 bp  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0751951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  100 
 
 		 462 bp  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0077  replication initiator protein  100 
 
 		 180 bp  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265046  normal  0.478776 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0054  insertion sequence  100 
 
 		 249 bp  125  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0114  hypothetical protein  100 
 
 		 300 bp  77.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0253401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0193    100 
 
 		 3052 bp  56  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.000000152133  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  91.89 
 
 		 546 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0811  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1074 bp  48.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>