19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0099 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0099  outer membrane protease  100 
 
 		 317 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0161825  hitchhiker  0.00000610402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1653  outer membrane protease  74.13 
 
 		 317 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00332397  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3064  Plasminogen activator Pla  73.19 
 
 		 317 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00663458  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0311  outer membrane protease  58.68 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1900  outer membrane protease  46.52 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0009  outer membrane protease  45.4 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0023  outer membrane protease  45.4 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2624  outer membrane protease  44.13 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2648  outer membrane protease  46.05 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2584  outer membrane protease  46.05 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2753  outer membrane protease  46.05 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.78481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2535  outer membrane protease  46.05 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2452  outer membrane protease  39.3 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2311  outer membrane protease  38.59 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1453  outer membrane protease  39.31 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal  0.752395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2831  outer membrane protease  38.97 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0057  outer membrane protease  24.76 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.581997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1618  outer membrane protease  26.67 
 
 		 238 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1643  outer membrane protease  24.39 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>