21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1643 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1643  outer membrane protease  100 
 
 		 373 aa  765    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0057  outer membrane protease  28.01 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.581997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1618  outer membrane protease  33.62 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918061  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5994  hypothetical protein  81.03 
 
 		 81 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6058  hypothetical protein  81.03 
 
 		 81 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2624  outer membrane protease  25.78 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2648  outer membrane protease  25.47 
 
 		 312 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2584  outer membrane protease  25.47 
 
 		 312 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2753  outer membrane protease  25.16 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.78481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2535  outer membrane protease  25.16 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1653  outer membrane protease  24.84 
 
 		 317 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00332397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1900  outer membrane protease  25.08 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3064  Plasminogen activator Pla  24.84 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00663458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1453  outer membrane protease  24.12 
 
 		 311 aa  85.9  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal  0.752395 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0023  outer membrane protease  23.29 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0009  outer membrane protease  23.29 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2831  outer membrane protease  24.39 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2311  outer membrane protease  23.15 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2452  outer membrane protease  22.7 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0099  outer membrane protease  24.39 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0161825  hitchhiker  0.00000610402 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0311  outer membrane protease  24.51 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>