19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0023 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0009  outer membrane protease  100 
 
 
312 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0023  outer membrane protease  100 
 
 
312 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1900  outer membrane protease  79.17 
 
 
312 aa  527  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2753  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.78481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2535  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2648  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2584  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2624  outer membrane protease  72.12 
 
 
312 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2311  outer membrane protease  51.61 
 
 
308 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2452  outer membrane protease  48.06 
 
 
308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1653  outer membrane protease  48.43 
 
 
317 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00332397  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3064  Plasminogen activator Pla  47.8 
 
 
317 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00663458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1453  outer membrane protease  45.88 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal  0.752395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2831  outer membrane protease  45.52 
 
 
311 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0099  outer membrane protease  45.4 
 
 
317 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0161825  hitchhiker  0.00000610402 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0311  outer membrane protease  41.44 
 
 
326 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0057  outer membrane protease  28.4 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.581997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1618  outer membrane protease  28.76 
 
 
238 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1643  outer membrane protease  23.29 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>