19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2648 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2753  outer membrane protease  99.68 
 
 
312 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.78481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2535  outer membrane protease  99.68 
 
 
312 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2624  outer membrane protease  98.72 
 
 
312 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2648  outer membrane protease  100 
 
 
312 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2584  outer membrane protease  100 
 
 
312 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1900  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0009  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0023  outer membrane protease  72.44 
 
 
312 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1653  outer membrane protease  46.88 
 
 
317 aa  298  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00332397  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3064  Plasminogen activator Pla  46.56 
 
 
317 aa  298  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00663458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2452  outer membrane protease  45.9 
 
 
308 aa  292  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2311  outer membrane protease  45.9 
 
 
308 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1453  outer membrane protease  42.68 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal  0.752395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2831  outer membrane protease  42.36 
 
 
311 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0099  outer membrane protease  46.05 
 
 
317 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0161825  hitchhiker  0.00000610402 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0311  outer membrane protease  38.05 
 
 
326 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0057  outer membrane protease  27.19 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.581997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1643  outer membrane protease  25.47 
 
 
373 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1618  outer membrane protease  25.66 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>