27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4889 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  100 
 
 		 132 aa  278  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  94.69 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.674922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  93.81 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  93.81 
 
 		 113 aa  220  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  92.92 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  77.27 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  70.64 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0319  hypothetical protein  53.7 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  49.3 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0325  hypothetical protein  50.88 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0354  hypothetical protein  38.57 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0318  hypothetical protein  60.53 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1921  hypothetical protein  45.83 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  31.48 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0444  hypothetical protein  37.21 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1915  hypothetical protein  45.83 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0309  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1999  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03337  transposase  42 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  31.58 
 
 		 112 aa  43.9  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  51.43 
 
 		 89 aa  43.5  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0336  hypothetical protein  38.89 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1990  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01803  hypothetical protein  38.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.124801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1927  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0605434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2010  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>