17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2010 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1915  hypothetical protein  97.14 
 
 
95 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2010  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1927  hypothetical protein  97.14 
 
 
70 aa  144  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0605434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1990  hypothetical protein  95.71 
 
 
70 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1921  hypothetical protein  94.2 
 
 
95 aa  143  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0309  hypothetical protein  92.86 
 
 
95 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1999  hypothetical protein  92.86 
 
 
95 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0444  hypothetical protein  58.21 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  53.12 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0316  hypothetical protein  50.79 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397578  normal  0.419691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  44.93 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0324  hypothetical protein  43.1 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.136473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  57.14 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  51.52 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  40 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  48.48 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  48.48 
 
 
113 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>