30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2815 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  227  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  75.23 
 
 
112 aa  175  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  82.02 
 
 
89 aa  154  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2570  hypothetical protein  84.91 
 
 
53 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1921  hypothetical protein  44.44 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1915  hypothetical protein  45.26 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1999  hypothetical protein  44.21 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0309  hypothetical protein  44.21 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0444  hypothetical protein  37.74 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1990  hypothetical protein  53.03 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1927  hypothetical protein  51.52 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0605434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2010  hypothetical protein  53.12 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0316  hypothetical protein  41.18 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397578  normal  0.419691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  46.27 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0336  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  37.04 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  35.96 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  35.8 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4306  hypothetical protein  46.15 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.17511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  35.8 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0324  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.136473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  31.48 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  36.49 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  50 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0354  hypothetical protein  32.26 
 
 
103 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0325  hypothetical protein  34 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0319  hypothetical protein  48.48 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0318  hypothetical protein  35.42 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4273  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0439  hypothetical protein  34.69 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>