20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0309 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1999  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  201  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0309  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  201  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1921  hypothetical protein  97.87 
 
 
95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1915  hypothetical protein  96.84 
 
 
95 aa  193  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1990  hypothetical protein  97.14 
 
 
70 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1927  hypothetical protein  95.71 
 
 
70 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0605434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2010  hypothetical protein  92.86 
 
 
70 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0444  hypothetical protein  47.19 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  44.21 
 
 
109 aa  91.3  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  39 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0316  hypothetical protein  49.23 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397578  normal  0.419691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  41.25 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0324  hypothetical protein  42.37 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.136473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  45.83 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  43.75 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  40.32 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  43.75 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  38.46 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  43.75 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  41.67 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>