23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1158 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  186  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  82.02 
 
 
109 aa  154  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  77.53 
 
 
112 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2570  hypothetical protein  88.68 
 
 
53 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1921  hypothetical protein  42.5 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1915  hypothetical protein  42.5 
 
 
95 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0309  hypothetical protein  41.25 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1999  hypothetical protein  41.25 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1927  hypothetical protein  54.9 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0605434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1990  hypothetical protein  54.9 
 
 
70 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2010  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  41.79 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0444  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0336  hypothetical protein  41.18 
 
 
74 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4306  hypothetical protein  43.08 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.17511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  51.43 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  51.43 
 
 
132 aa  43.5  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  51.43 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  42.31 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  36.99 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0316  hypothetical protein  36.96 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397578  normal  0.419691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  51.43 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  51.52 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.784941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>