18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0336 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4306  hypothetical protein  57.14 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.17511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4273  hypothetical protein  60.32 
 
 		 63 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0439  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2570  hypothetical protein  49.02 
 
 		 53 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  39.71 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  42.59 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  40.74 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  39.71 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  37.1 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  40.74 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3210  hypothetical protein  37.68 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  40.74 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  38.89 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03337  transposase  50 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>