15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0325 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0325  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  190  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0333  hypothetical protein  81.32 
 
 		 87 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39076  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0318  hypothetical protein  74.07 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0319  hypothetical protein  70.37 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0354  hypothetical protein  53.75 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0336  hypothetical protein  56.6 
 
 		 57 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  42.86 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  50.88 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  49.12 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  49.12 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  39.47 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  47.37 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  43.64 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  34 
 
 		 109 aa  43.9  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>