16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0319 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0319  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0318  hypothetical protein  83.53 
 
 		 85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0325  hypothetical protein  70.37 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0354  hypothetical protein  68.35 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0333  hypothetical protein  59.26 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39076  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0336  hypothetical protein  79.31 
 
 		 57 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  50.82 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  53.7 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  53.7 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  53.7 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  53.7 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  46.55 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  51.85 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  44.64 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3210  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  48.48 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>