51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3151 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  94.65 
 
 		 1572 bp  1281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  94.65 
 
 		 1572 bp  1281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  94.65 
 
 		 1572 bp  1281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  94.89 
 
 		 1575 bp  1296    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3151    100 
 
 		 822 bp  1629    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  94.65 
 
 		 1572 bp  1281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  94.25 
 
 		 912 bp  1221    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  94.65 
 
 		 1572 bp  1281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  94.65 
 
 		 1572 bp  1281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  91.76 
 
 		 1233 bp  355  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0055  Aec53  98.64 
 
 		 147 bp  276  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0058  transposase family  88.24 
 
 		 138 bp  125  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0290  transposase family  92.73 
 
 		 375 bp  77.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.19364e-43  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4273  ISSfl4 ORF3  100 
 
 		 621 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4654    91.11 
 
 		 408 bp  58  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2933    81.42 
 
 		 1540 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  81.42 
 
 		 1539 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0224  ShiE  100 
 
 		 201 bp  52  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4296    96.43 
 
 		 1404 bp  48.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  96.43 
 
 		 717 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  96.43 
 
 		 1542 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  96.43 
 
 		 1602 bp  48.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1608  transposase family  96.43 
 
 		 432 bp  48.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.61911e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  96.43 
 
 		 1572 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>