25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0143 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  66.67 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  66.67 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  65.15 
 
 		 298 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  65.15 
 
 		 300 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  65.15 
 
 		 300 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  65.15 
 
 		 300 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  65.15 
 
 		 300 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  63.64 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  55.56 
 
 		 306 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  37.14 
 
 		 302 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  34.33 
 
 		 307 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  35.21 
 
 		 311 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  35.21 
 
 		 311 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  35.21 
 
 		 311 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  31.43 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  40 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3455  hypothetical protein  40.68 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  35.85 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  33.82 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  41.07 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>