18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3980 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5486  ShET2 enterotoxin, N- region family  96.84 
 
 		 728 aa  1466    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3980  ShET2 enterotoxin domain protein  100 
 
 		 728 aa  1513    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4013  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  81.64 
 
 		 524 aa  824    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4560  ankyrin repeat-containing protein  81.24 
 
 		 524 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1471  ankyrin repeat-containing protein  29.78 
 
 		 632 aa  251  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2438  hypothetical protein  30.29 
 
 		 632 aa  250  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0495046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5138  ShET2 enterotoxin, N- region family  26.42 
 
 		 662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103144  normal  0.23823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  100 
 
 		 141 aa  177  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0022  OspD2  22.59 
 
 		 569 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1962  ankyrin repeat protein B  26 
 
 		 253 aa  94  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4284  Ent protein  23.21 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0671  putative enterotoxin  31.25 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0108  OspD3  23.33 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0741  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  23.78 
 
 		 498 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0937  ShET2 enterotoxin  24.93 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0440491  normal  0.264318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3408  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  24.93 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3275  putative enterotoxin  24.64 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0023  hypothetical protein  23.17 
 
 		 770 aa  45.4  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>