10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1962 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1962  ankyrin repeat protein B  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2438  hypothetical protein  92.49 
 
 		 632 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0495046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1471  ankyrin repeat-containing protein  90.51 
 
 		 632 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103946  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3980  ShET2 enterotoxin domain protein  26 
 
 		 728 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5486  ShET2 enterotoxin, N- region family  25.6 
 
 		 728 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0022  OspD2  24.26 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4284  Ent protein  25.88 
 
 		 549 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0108  OspD3  23.81 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5138  ShET2 enterotoxin, N- region family  27.18 
 
 		 662 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103144  normal  0.23823 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0039  OspD1  25.58 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>