15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0108 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0108  OspD3  100 
 
 		 565 aa  1158    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0022  OspD2  39.48 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4284  Ent protein  39.29 
 
 		 549 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0741  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  29 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0671  putative enterotoxin  29.19 
 
 		 496 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2438  hypothetical protein  23.08 
 
 		 632 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0495046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0937  ShET2 enterotoxin  26.76 
 
 		 395 aa  88.6  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0440491  normal  0.264318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3408  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  26.76 
 
 		 395 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1471  ankyrin repeat-containing protein  20.96 
 
 		 632 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3275  putative enterotoxin  26.21 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5138  ShET2 enterotoxin, N- region family  23.38 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103144  normal  0.23823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3980  ShET2 enterotoxin domain protein  23.33 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0039  OspD1  37.01 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5486  ShET2 enterotoxin, N- region family  22.75 
 
 		 728 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1962  ankyrin repeat protein B  23.81 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>