16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1471 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1471  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 		 632 aa  1310    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2438  hypothetical protein  95.09 
 
 		 632 aa  1246    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0495046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1962  ankyrin repeat protein B  90.51 
 
 		 253 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3980  ShET2 enterotoxin domain protein  29.78 
 
 		 728 aa  251  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5486  ShET2 enterotoxin, N- region family  29.43 
 
 		 728 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5138  ShET2 enterotoxin, N- region family  26.35 
 
 		 662 aa  193  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103144  normal  0.23823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4560  ankyrin repeat-containing protein  28.66 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4013  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  28.66 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0671  putative enterotoxin  30.85 
 
 		 496 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0741  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  30.14 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0108  OspD3  20.96 
 
 		 565 aa  87.8  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0022  OspD2  24.11 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4284  Ent protein  21.27 
 
 		 549 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0937  ShET2 enterotoxin  35.26 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0440491  normal  0.264318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3408  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  35.26 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3275  putative enterotoxin  35.26 
 
 		 427 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>