13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4013 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3980  ShET2 enterotoxin domain protein  81.64 
 
 		 728 aa  824    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4560  ankyrin repeat-containing protein  99.24 
 
 		 524 aa  1088    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4013  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  100 
 
 		 524 aa  1096    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5486  ShET2 enterotoxin, N- region family  83.12 
 
 		 728 aa  803    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2438  hypothetical protein  31.19 
 
 		 632 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0495046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1471  ankyrin repeat-containing protein  28.66 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  97.56 
 
 		 141 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5138  ShET2 enterotoxin, N- region family  27.53 
 
 		 662 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103144  normal  0.23823 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0671  putative enterotoxin  31.25 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0741  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  30.25 
 
 		 498 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3275  putative enterotoxin  28.98 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0937  ShET2 enterotoxin  27.84 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0440491  normal  0.264318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3408  ShET2 enterotoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>