15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1105 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1105  TadE family protein  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  63.11 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2367  hypothetical protein  56.8 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00108098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  30.51 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  28.16 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  31.94 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  29.32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  38.16 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  38.16 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  38.16 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  39.47 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  38 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  36.84 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  32.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  44.68 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>