18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2367 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2367  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00108098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  60 
 
 
145 aa  153  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1105  TadE family protein  56.8 
 
 
129 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  29.92 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  40 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  34.52 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  28.46 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  34.23 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  31.4 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  28.15 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  39.66 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  37.5 
 
 
181 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  35.19 
 
 
148 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  30.86 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03343  Flp pilus assembly protein TadG  29.31 
 
 
502 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  30.26 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  37.5 
 
 
140 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>