24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0052 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0052  TadE family protein  100 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.780206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  25.93 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.46 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  33.98 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  36.78 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  28.99 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  28.93 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  28.18 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  41.07 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  34.19 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.35 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  37.04 
 
 		 209 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  30.33 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  28.75 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  29.13 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  24.58 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  32.31 
 
 		 278 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>