144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0526 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0526  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
199 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3762  Dak phosphatase  42.86 
 
 
204 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.4 
 
 
212 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2359  DAK2 domain-containing protein  33.82 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  28.57 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.98 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.8 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  28.35 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.68 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.44 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3315  Dak phosphatase  36.72 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  29.38 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  30.3 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.73 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.77 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  32.61 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  32.61 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.15 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.33 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  27.96 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.64 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.33 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  31.89 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  31.9 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  27.49 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  27.51 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  27.49 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  27.49 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  27.49 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  27.49 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.99 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  27.49 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.08 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4367  Dak phosphatase  33.33 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.79 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.4 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.76 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.7 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.47 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.07 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.07 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.05 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  30.65 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.92 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.29 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  25.84 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  28.25 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  26.53 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.89 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.12 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  28.64 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.79 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  29.08 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  31.07 
 
 
566 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  29.26 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  28.9 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  27.75 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.15 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  26.63 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.9 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  27.75 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.65 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.74 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.74 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  27.17 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  24.39 
 
 
583 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.87 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.57 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  23.9 
 
 
583 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  23.9 
 
 
583 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  27.88 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  23.9 
 
 
583 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  35.91 
 
 
569 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  23.41 
 
 
583 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.34 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  29.47 
 
 
546 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  24.86 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  30.73 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.13 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  30.73 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  30.73 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  24.86 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  24.86 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  23.41 
 
 
583 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  24.74 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.73 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  30.73 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  31.25 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  23.41 
 
 
583 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  35.77 
 
 
544 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  29.95 
 
 
576 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  23.41 
 
 
583 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  22.93 
 
 
583 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.12 
 
 
213 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  28.25 
 
 
598 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  22.93 
 
 
583 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.15 
 
 
210 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.64 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  25.41 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.84 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>