250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3329 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3329  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000648076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.1  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 48 aa  60.1  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 49 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 48 aa  58.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4961  50S ribosomal protein L34  86.67 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000209514  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 54 aa  57  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 47 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0926  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320545  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 52 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 53 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0767  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0001  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 45 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00632016  hitchhiker  0.00000658518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 53 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 53 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4864  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 46 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  58.14 
 
 		 45 aa  50.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 46 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  66.67 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  63.64 
 
 		 44 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 52 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>