248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0926 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0926  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 46 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320545  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  95.65 
 
 		 46 aa  87  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  95.65 
 
 		 46 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0767  ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  69.05 
 
 		 46 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  73.17 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 48 aa  57  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  62.22 
 
 		 51 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  60 
 
 		 52 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  60.47 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  64.29 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1628  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.499577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  68.29 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  55.81 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  62.22 
 
 		 45 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 51 aa  51.6  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 		 45 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  55.81 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1423  ribosomal protein L34  74.19 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3967  ribosomal protein L34  74.19 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.104672  normal  0.084456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 49 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 		 45 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  69.23 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 46 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  61.9 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  61.9 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 46 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  69.23 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>