35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0802 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0802  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  23.22 
 
 
431 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.4 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.34 
 
 
389 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.4 
 
 
414 aa  50.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.16 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.09 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  24.43 
 
 
260 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  23.22 
 
 
771 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  22.83 
 
 
262 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  21.66 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  23.58 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.24 
 
 
263 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  23.59 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.22 
 
 
264 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  24.24 
 
 
263 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.24 
 
 
263 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.24 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.81 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.48 
 
 
336 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  21.4 
 
 
265 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  24.24 
 
 
263 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.76 
 
 
446 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 
256 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 
358 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.43 
 
 
314 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.53 
 
 
301 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.15 
 
 
398 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  23.22 
 
 
401 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
265 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1056  chromosome partitioning ATPase  23.2 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  hitchhiker  0.00567029 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  24.09 
 
 
260 aa  43.5  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1410  hypothetical protein  38.1 
 
 
223 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.499292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01091  hypothetical protein  38.1 
 
 
223 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.535106  normal  0.920257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>