More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1923 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1923  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00262008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.15 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.88 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.79 
 
 
258 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.6 
 
 
258 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.93 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2519  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.4 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.74 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.85 
 
 
286 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1333  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.55 
 
 
258 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.63 
 
 
258 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.64 
 
 
258 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.14 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2263  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.55 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.204699  hitchhiker  0.00000125748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.25 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1270  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0920  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.9 
 
 
264 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.58 
 
 
263 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0387  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.69 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.69 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.69 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.63 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3331  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.21 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.96 
 
 
252 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.61 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.13 
 
 
249 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.13 
 
 
249 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  36.36 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.59 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.09 
 
 
257 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.82 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02100  mitochondrion protein, putative  32.24 
 
 
265 aa  112  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.11 
 
 
249 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.57 
 
 
249 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.27 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5957  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.47 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.65 
 
 
249 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.46 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.1 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1389  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.94 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.43 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.82 
 
 
249 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.1 
 
 
249 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.26 
 
 
249 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.09 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.86 
 
 
249 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.92 
 
 
249 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.65 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.09 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.65 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.72 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.45 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.5 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.96 
 
 
262 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.43 
 
 
257 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.59 
 
 
255 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3826  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.3 
 
 
263 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.18221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.51 
 
 
249 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  32.43 
 
 
257 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  32.43 
 
 
257 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.49 
 
 
249 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10278  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07300)  32.17 
 
 
261 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19095  normal  0.236611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.05 
 
 
257 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.95 
 
 
250 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  32.05 
 
 
257 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.36 
 
 
249 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.04 
 
 
249 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.05 
 
 
257 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  36.74 
 
 
249 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.33 
 
 
249 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.19 
 
 
248 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.09 
 
 
249 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.49 
 
 
249 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.49 
 
 
249 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.09 
 
 
249 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.02 
 
 
249 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.2 
 
 
258 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.4 
 
 
257 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.02 
 
 
249 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.02 
 
 
249 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.02 
 
 
249 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.5 
 
 
249 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.49 
 
 
249 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  32.05 
 
 
257 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.15 
 
 
249 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.02 
 
 
249 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.54 
 
 
249 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.05 
 
 
257 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.2 
 
 
249 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.5 
 
 
249 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.46 
 
 
263 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.5 
 
 
250 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.66 
 
 
257 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.87 
 
 
249 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.1 
 
 
249 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.66 
 
 
257 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.89 
 
 
249 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.67 
 
 
249 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.52 
 
 
260 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.89 
 
 
249 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>