More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1418 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1418  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00419162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2266  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.69 
 
 
260 aa  359  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0330642  hitchhiker  0.0000280428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0462  electron transfer flavoprotein, beta-subunit  62.16 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.13 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0387  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.69 
 
 
262 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3331  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.83 
 
 
264 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1389  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.21 
 
 
263 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3826  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.3 
 
 
263 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.18221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.89 
 
 
260 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.41 
 
 
258 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.83 
 
 
263 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.55 
 
 
258 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1333  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.68 
 
 
258 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.94 
 
 
258 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1270  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.16 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.36 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.77 
 
 
260 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.16 
 
 
258 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5957  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.02 
 
 
266 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.29 
 
 
258 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.52 
 
 
258 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.98 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.62 
 
 
258 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.59 
 
 
286 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.86 
 
 
257 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.4 
 
 
257 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.61 
 
 
255 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2519  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.27 
 
 
258 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.91 
 
 
259 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.91 
 
 
249 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.05 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  37.73 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.48 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  35.66 
 
 
257 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.99 
 
 
252 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.8 
 
 
248 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.5 
 
 
257 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.45 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.8 
 
 
248 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.8 
 
 
248 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.66 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  35.66 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.66 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.66 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.66 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.81 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.64 
 
 
261 aa  138  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.27 
 
 
257 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.84 
 
 
266 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.31 
 
 
258 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.42 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.23 
 
 
262 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.27 
 
 
257 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.27 
 
 
257 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.27 
 
 
257 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.72 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.72 
 
 
249 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.14 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.92 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.84 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.72 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0920  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.55 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.82 
 
 
249 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.82 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.95 
 
 
249 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.4 
 
 
249 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.4 
 
 
249 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.75 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.87 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.6 
 
 
249 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.8 
 
 
249 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.8 
 
 
249 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.85 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.84 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.94 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.16 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.7 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.5 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.5 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3570  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  35.48 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.61 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.84 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.72 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.35 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.2 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.51 
 
 
259 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.14 
 
 
259 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.29 
 
 
249 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.55 
 
 
249 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.89 
 
 
249 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>