26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0588 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0588  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1081    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.296421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1518  hypothetical protein  32.92 
 
 
496 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2581  myosin-like domain-containing protein  33.2 
 
 
481 aa  98.2  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.249258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4470  hypothetical protein  24.76 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0829  hypothetical protein  26.25 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1067  hypothetical protein  29.01 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.363484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17480  hypothetical protein  25.24 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2083  uncharacterized protein with the myosin-like domain  25.28 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.898703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2059  hypothetical protein  25.28 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3282  hypothetical protein  25.56 
 
 
496 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0128  hypothetical protein  32.67 
 
 
432 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0658  hypothetical protein  25.93 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2022  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.051026 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0268  hypothetical protein  31.71 
 
 
383 aa  62  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2076  hypothetical protein  29.81 
 
 
383 aa  57  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0249  hypothetical protein  24.64 
 
 
319 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03251  hypothetical protein  32.5 
 
 
308 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1613  hypothetical protein  32.5 
 
 
308 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24571  hypothetical protein  27.11 
 
 
401 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02721  hypothetical protein  40.74 
 
 
325 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.957585  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.49 
 
 
1182 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  21.96 
 
 
1182 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 
1193 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  25.89 
 
 
864 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02801  hypothetical protein  41.67 
 
 
323 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  25.88 
 
 
413 aa  43.5  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.855575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>