24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4448 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4448  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  100 
 
 		 134 aa  261  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  28.33 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  26.27 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1484  hypothetical protein  37.97 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  37.97 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  30.49 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  33.98 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1451  hypothetical protein  30.97 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000234748  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  32.14 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1174  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0179647  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  21.98 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4585  hypothetical protein  32.98 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0352075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  27.08 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2019  hypothetical protein  36.51 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  28.26 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2553  conserved hypothetical protein  54.29 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 627 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  28.24 
 
 		 708 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1166  hypothetical protein  26.72 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31751  predicted protein  24.03 
 
 		 709 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0549  hypothetical protein  28.87 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  25.64 
 
 		 745 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1116  hypothetical protein  35.42 
 
 		 90 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00693597  normal  0.677465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>