18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1451 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000234748  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4448  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  30.97 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3903  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1166  hypothetical protein  35.19 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3854  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  36.76 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  39.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  25.76 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  32.88 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1174  hypothetical protein  47.5 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0179647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  26.83 
 
 		 866 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  37.7 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  32.14 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0484  hypothetical protein  47.73 
 
 		 114 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>