More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1839 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1839  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
355 aa  722    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1668  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.86 
 
 
350 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269909  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1672  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.32 
 
 
351 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.27 
 
 
350 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.31 
 
 
353 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.28 
 
 
354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.23 
 
 
348 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.81 
 
 
348 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.62 
 
 
350 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.24 
 
 
348 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.67 
 
 
348 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.24 
 
 
349 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
348 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.44 
 
 
345 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.1 
 
 
350 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.2 
 
 
348 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.85 
 
 
345 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.13 
 
 
345 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.03 
 
 
359 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.03 
 
 
350 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.46 
 
 
349 aa  364  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.24 
 
 
363 aa  362  4e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.26 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.57 
 
 
345 aa  362  6e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.01 
 
 
352 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.96 
 
 
350 aa  361  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.33 
 
 
350 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.17 
 
 
349 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.13 
 
 
347 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.13 
 
 
347 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
336 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.13 
 
 
347 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1476  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.33 
 
 
354 aa  359  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.35 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.86 
 
 
346 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.14 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.93 
 
 
346 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.51 
 
 
345 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.87 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0399  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.98 
 
 
342 aa  352  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.862659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
346 aa  352  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  352  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.69 
 
 
345 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.57 
 
 
345 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
345 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.4 
 
 
345 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.57 
 
 
345 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.1 
 
 
379 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.4 
 
 
345 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
368 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.14 
 
 
368 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.3 
 
 
346 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.41 
 
 
363 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.48 
 
 
352 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51 
 
 
345 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
345 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
345 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
345 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.89 
 
 
345 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.34 
 
 
358 aa  345  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.29 
 
 
350 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.29 
 
 
350 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.83 
 
 
345 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.02 
 
 
346 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.24 
 
 
359 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.24 
 
 
359 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.44 
 
 
356 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
346 aa  342  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.33 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.89 
 
 
354 aa  342  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.7 
 
 
352 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
349 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.04 
 
 
369 aa  342  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.24 
 
 
363 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
346 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.62 
 
 
353 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.02 
 
 
346 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.02 
 
 
346 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.01 
 
 
346 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.76 
 
 
349 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.429765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.41 
 
 
355 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
357 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.63 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2421  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.76 
 
 
349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0516  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.2 
 
 
347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.706713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>