25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1132 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  77.59 
 
 		 174 aa  271  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  76.44 
 
 		 174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  74.71 
 
 		 174 aa  260  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  76.44 
 
 		 174 aa  253  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  66.47 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  60.12 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  60.69 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  60.74 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2937  putative DNA-binding protein  60.71 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0469777  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  43.02 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  45.83 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2489  putative DNA-binding protein  44.97 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  49.02 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1999  putative DNA-binding protein  46.99 
 
 		 89 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.0610566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1972  putative DNA-binding protein  46.99 
 
 		 89 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  35.67 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2688  putative DNA-binding protein  54.67 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4840  putative DNA-binding protein  47.56 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3698  hypothetical protein  32 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1943  hypothetical protein  30.5 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1970  hypothetical protein  30.5 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3363  prophage CP4-57 regulatory  36.36 
 
 		 80 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  33.72 
 
 		 306 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0183  Prophage CP4-57 regulatory  27.01 
 
 		 305 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>