23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3698 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  36.87 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1970  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1943  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  35.76 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  33.33 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  31.93 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2489  putative DNA-binding protein  36.48 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  34.33 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  36.59 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  32.31 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  33.08 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  33.08 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  34.17 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  34.51 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1972  putative DNA-binding protein  36.25 
 
 		 89 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4296  hypothetical protein  26.38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  32.84 
 
 		 306 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1999  putative DNA-binding protein  33.75 
 
 		 89 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.0610566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2937  putative DNA-binding protein  31.54 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0469777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  43.08 
 
 		 680 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>