25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0495 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  89.66 
 
 		 174 aa  317  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  86.78 
 
 		 174 aa  284  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  81.61 
 
 		 174 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  74.71 
 
 		 174 aa  260  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  71.26 
 
 		 174 aa  255  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  64.94 
 
 		 174 aa  227  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  62.64 
 
 		 174 aa  224  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  64.6 
 
 		 166 aa  193  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  40.12 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2489  putative DNA-binding protein  48.48 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2937  putative DNA-binding protein  58.57 
 
 		 139 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0469777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  44.1 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  44.1 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1999  putative DNA-binding protein  46.99 
 
 		 89 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.0610566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1972  putative DNA-binding protein  46.99 
 
 		 89 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  36.31 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4840  putative DNA-binding protein  47.56 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2688  putative DNA-binding protein  52 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1943  hypothetical protein  30.94 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1970  hypothetical protein  30.94 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0183  Prophage CP4-57 regulatory  34.06 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3363  prophage CP4-57 regulatory  38.96 
 
 		 80 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  28.47 
 
 		 306 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>