20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1943 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1943  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  42.45 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3698  hypothetical protein  35.14 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  28.66 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4296  hypothetical protein  36.26 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  29.68 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  32.3 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  30.97 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  30.94 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  30.28 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  30.5 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  31.88 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2489  putative DNA-binding protein  29.87 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  29.29 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  31.65 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  26.95 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0183  Prophage CP4-57 regulatory  24.85 
 
 		 305 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  25.6 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>