17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0183 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0183  Prophage CP4-57 regulatory  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  56.15 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  35.51 
 
 		 174 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  31.39 
 
 		 174 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  34.06 
 
 		 174 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  31.15 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  26.92 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  35.51 
 
 		 174 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  29.63 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  30.43 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  31.63 
 
 		 174 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 174 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1943  hypothetical protein  24.85 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1970  hypothetical protein  24.85 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4296  hypothetical protein  37.66 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>