20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0699 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0183  Prophage CP4-57 regulatory  56.15 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1970  hypothetical protein  28.66 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1943  hypothetical protein  28.66 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  28.09 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  30.66 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  32.61 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  29.93 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4296  hypothetical protein  29.19 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  34.12 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  37.66 
 
 		 174 aa  49.3  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  35.96 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  32.58 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  28.47 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  33.72 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2937  putative DNA-binding protein  38.27 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0469777  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  25.19 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3698  hypothetical protein  32.84 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  32.56 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>