19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2937 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2937  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0469777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1132  phage transcriptional regulator, AlpA  60.71 
 
 		 174 aa  169  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3482  phage transcriptional regulator, AlpA  59.29 
 
 		 174 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1264  phage transcriptional regulator, AlpA  59.29 
 
 		 174 aa  164  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1467  prophage CP4-57 regulatory  58.57 
 
 		 174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0495  prophage CP4-57 regulatory  58.57 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3194  putative transcriptional regulator  55.07 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2019  prophage CP4-57 regulatory  51.8 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1360  phage transcriptional regulator, AlpA  52.52 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104644  hitchhiker  0.00829319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1704  prophage CP4-57 regulatory  62.63 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5687  prophage CP4-57 regulatory  39.57 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2489  putative DNA-binding protein  42.19 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2946  putative DNA-binding protein  41.32 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.877107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0794  prophage CP4-57 regulatory  46.22 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30631 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0103  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0873200000000001e-63  hitchhiker  1.60772e-129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1972  putative DNA-binding protein  46 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1999  putative DNA-binding protein  44 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.0610566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0699  hypothetical protein  38.27 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3698  hypothetical protein  31.54 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>