40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2679 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2679  phosphoesterase, DHHA1  100 
 
 
335 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.0566213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2280  phosphoesterase, DHHA1  36.28 
 
 
320 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0179522  hitchhiker  0.00000317774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0157  phosphoesterase, DHHA1  35.22 
 
 
300 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1325  phosphoesterase, DHHA1  32.74 
 
 
311 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.916947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2477  phosphoesterase, DHHA1  32.12 
 
 
340 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.634676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1358  phosphoesterase DHHA1  33.85 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2502  phosphoesterase, DHHA1  33.85 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.0434715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1390  phosphoesterase, DHHA1  32 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2463  hypothetical protein  38.25 
 
 
280 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3549  DHH superfamily phosphohydrolase  31.87 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000675489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0354  phosphoesterase DHHA1  26.79 
 
 
283 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0118  hypothetical protein  25.53 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0060  phosphoesterase DHHA1  21.97 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00992253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  54.76 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  25.3 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0637  DHH family protein  40.91 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000263818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  42.19 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  42.19 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  54 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  48.15 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  48.15 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  44.68 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  57.89 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  46 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  53.33 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  47.27 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  32.14 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  36.62 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  55.26 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  35.71 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  42.37 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2539  hypothetical protein  21.86 
 
 
413 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  58.82 
 
 
353 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  50 
 
 
324 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  45.45 
 
 
331 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  42.86 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.97 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  47.73 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  47.37 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  55.26 
 
 
317 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>