15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3549 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3549  DHH superfamily phosphohydrolase  100 
 
 
315 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000675489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2463  hypothetical protein  71.33 
 
 
280 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2679  phosphoesterase, DHHA1  31.87 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.0566213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0157  phosphoesterase, DHHA1  32.4 
 
 
300 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1325  phosphoesterase, DHHA1  31.6 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.916947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2280  phosphoesterase, DHHA1  31.82 
 
 
320 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0179522  hitchhiker  0.00000317774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1358  phosphoesterase DHHA1  33.22 
 
 
315 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2502  phosphoesterase, DHHA1  33.22 
 
 
315 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.0434715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2477  phosphoesterase, DHHA1  29.56 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.634676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1390  phosphoesterase, DHHA1  32.87 
 
 
308 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0354  phosphoesterase DHHA1  27.9 
 
 
283 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0118  hypothetical protein  25.52 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0060  phosphoesterase DHHA1  24.77 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00992253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  60 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  51.02 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>