18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2477 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2477  phosphoesterase, DHHA1  100 
 
 
340 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.634676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1325  phosphoesterase, DHHA1  68.4 
 
 
311 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.916947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0157  phosphoesterase, DHHA1  66 
 
 
300 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1390  phosphoesterase, DHHA1  67.33 
 
 
308 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2280  phosphoesterase, DHHA1  60.19 
 
 
320 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0179522  hitchhiker  0.00000317774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1358  phosphoesterase DHHA1  62.54 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2502  phosphoesterase, DHHA1  62.54 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.0434715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2679  phosphoesterase, DHHA1  32.12 
 
 
335 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.0566213 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0354  phosphoesterase DHHA1  28.04 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3549  DHH superfamily phosphohydrolase  28.4 
 
 
315 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000675489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2463  hypothetical protein  30.49 
 
 
280 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0118  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0060  phosphoesterase DHHA1  25.44 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00992253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  24.71 
 
 
652 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  24.71 
 
 
652 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  22.57 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2207  phosphoesterase DHHA1  21.49 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  40.43 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>