17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2463 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2463  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3549  DHH superfamily phosphohydrolase  71.33 
 
 
315 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000675489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2679  phosphoesterase, DHHA1  34.91 
 
 
335 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.0566213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1358  phosphoesterase DHHA1  36.27 
 
 
315 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2502  phosphoesterase, DHHA1  36.27 
 
 
315 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.0434715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2280  phosphoesterase, DHHA1  33.68 
 
 
320 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0179522  hitchhiker  0.00000317774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1325  phosphoesterase, DHHA1  32.4 
 
 
311 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.916947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0157  phosphoesterase, DHHA1  34.49 
 
 
300 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1390  phosphoesterase, DHHA1  35.29 
 
 
308 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2477  phosphoesterase, DHHA1  31.1 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.634676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0354  phosphoesterase DHHA1  28.42 
 
 
283 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0118  hypothetical protein  24.83 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0060  phosphoesterase DHHA1  22.97 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00992253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  62.5 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  61.29 
 
 
332 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  29.92 
 
 
341 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  62.86 
 
 
330 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>