18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2539 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2539  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  855    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1635  hypothetical protein  70.59 
 
 
412 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1809  phosphoesterase, DHHA1  25.85 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.493608  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0961  hypothetical protein  23.6 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0964  RecJ-like exonuclease  25.67 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1026  hypothetical protein  23.6 
 
 
348 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0266908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0225  RecJ-like exonuclease  23.53 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.387144  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0889  hypothetical protein  23.6 
 
 
348 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1366  hypothetical protein  23.4 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1552  hypothetical protein  22.39 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.169776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0118  hypothetical protein  24.09 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0354  phosphoesterase DHHA1  23.2 
 
 
283 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0433  hypothetical protein  23.71 
 
 
323 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0940  hypothetical protein  22.28 
 
 
350 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.532408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0723  hypothetical protein  23.74 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00623576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2679  phosphoesterase, DHHA1  21.86 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.0566213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2207  phosphoesterase DHHA1  21.77 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1145  phosphoesterase DHHA1  25.62 
 
 
301 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.228943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>