17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0964 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0964  RecJ-like exonuclease  100 
 
 
355 aa  702    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0225  RecJ-like exonuclease  74.07 
 
 
359 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.387144  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1309  hypothetical protein  54.91 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2163  hypothetical protein  52.33 
 
 
409 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.491692  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3426  phosphohydrolase (DHH superfamily)-like protein  62.94 
 
 
421 aa  360  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2207  phosphoesterase DHHA1  25.86 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0433  hypothetical protein  27.7 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2823  phosphoesterase, DHHA1  30.85 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0808  phosphoesterase, DHHA1  28.72 
 
 
321 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1635  hypothetical protein  24.83 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2539  hypothetical protein  25.67 
 
 
413 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1526  DHH superfamily phosphohydrolase  22.59 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.390938 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0862  phosphoesterase, DHHA1  32.98 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2015  phosphoesterase, DHHA1  25.91 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  33.62 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  33.62 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0259  phosphoesterase DHHA1  23.24 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>