24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5041 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5041  band 7 protein  100 
 
 
466 aa  935    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184325  normal  0.952839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.35 
 
 
437 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  25.11 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  29.14 
 
 
268 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  26.48 
 
 
315 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  24.66 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  24.02 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  26 
 
 
307 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  29.02 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  22.62 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  23.65 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  27.85 
 
 
307 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  20.38 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  24.88 
 
 
301 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  24.53 
 
 
310 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  25 
 
 
362 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.67 
 
 
263 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  25 
 
 
362 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.53 
 
 
321 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  22.38 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  22.33 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.62 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  23.98 
 
 
278 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  33.58 
 
 
327 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>